Исследователи выявили многообразие вироидов и вирусоподобных агентов

Группа исследователей из Национальной медицинской библиотеки (NLM) и сотрудничающих академических исследовательских институтов разработала вычислительный конвейер для выявления и понимания вирусоподобных и ковалентно замкнутых кольцевых РНК (кзкРНК, также называемых просто кольцевыми РНК). Это тип одноцепочечной РНК, которая, в отличие от линейной РНК, образует ковалентно замкнутую непрерывную цепь. Результаты опубликованы в журнале клетка.

Вирусы представляют собой кольцевые РНК размером всего от 250 до 400 нуклеотидыЭто самый маленький и простой из известных инфекционных агентов. Считается, что они вызывают инфекции только у растений. Разнообразие вирусных и вирусоподобных вирусных РНК изучено недостаточно, что побуждает исследователей к дальнейшему изучению этих вирусных подтипов и их потенциальной распространенности в других хозяевах и средах.

Путем поиска в коллекции из 5131 метатранскриптома и 1344 растительных транскриптов вирусоподобных кзкРНК исследователи обнаружили 11378 вирусоподобных кзкРНК, охватывающих 4409 видовых комбинаций. Этот показатель был пятикратным увеличением по сравнению с ранее идентифицированными вирусоподобными элементами.

в этом многообразии группаИсследователи обнаружили, что эта отдельная группа Патогены Он не ограничивается несколькими растениями, как считалось ранее, а распространен во всех типах окружающей среды и хозяев, сравним с известными РНК-вирусами. Более того, были обнаружены дальние родственники вируса гепатита D человека (гепатит D), что пролило свет на происхождение этого важного патогена человека, а также на совершенно новые типы вирусов.

«Эта работа открывает новые направления для исследователей всего мира, — сказал Юджин Ф. Кунин, доктор философии, соавтор исследования и старший научный сотрудник отдела вычислительной биологии программы внутренних исследований NLM. «В настоящее время мы проводим некоторые последующие анализы», — добавил он.