Полнохромосомный референсный геном Spironucleus salmonicida

Кент, мл и другие. Системная гексаметидная инфекция (Protozoa, diplomonadida) у чавычи, разводимой в морской воде. Oncorhynchus tshawytscha. дис. Водные виды спорта. член. 1481-89 (1992).

Статья — Товар

Google ученый

Йоргенсен, А. и Стеруд, Э. Генотип морского патогена Спироноцеллий Барханос Из выращиваемого лосося по имени Спирононуклеус сальмонициды н. с. Дж. Эукариот. микробиол; 53531-541 (2006).

Статья — Товар

Google ученый

Уильямс, К.Ф. и другие. Спирононуклеус Виды: экономически важные патогены рыб и непрозрачные одноклеточные эукариоты. Дж. Аквак. Точность. Дэйв. S2002 (2011).

Google ученый

Monis, PT, Caccio, SM & Thompson, RCA Variation in лямблиозНа пути к таксономическому обзору пола. Паразитол направления. 2593-100 (2009).

Статья — Товар

Google ученый

Внутриклеточная инфекция с Спироноцеллий Барханос (Diplomonadida: Hexamitidae) на фермах арктического гольца Сальвлин Альбинус. дис. Водные виды спорта. член. 56155-61 (2003).

Статья — Товар

Google ученый

Смотреть. и другие. геном Спирононуклеус сальмонициды Он выделяет рыбный патоген, который адаптировался к изменчивой среде. Плюс Женя. 10e1004053 (2014).

Статья — Товар

Google ученый

Смотреть. и другие. Об обращении паразитизма: адаптация к свободному образу жизни через генетическое приобретение у дипломатов Трипомонас с. компьютер 1. БМС Биол. 1462 (2016).

Статья — Товар

Google ученый

Хименес-Гонсалес, А. и Андерссон, Дж. О. Реконструкция метаболизма иллюстрирует образ жизни последнего общего предка Diplomonadida. mSystems 5e00774-20 (2020).

Статья — Товар

Google ученый

Сюй, Ф., Джекс, А. и Свярд, С.Г. Эталонный геном в масштабе хромосомы для Кишечный лямблиоз ВБ. наук. данные 738 (2020).

КАС
Статья — Товар

Google ученый

Смотреть. и другие. Компактный геном Джардия Моррис Он раскрывает важные этапы эволюции простейших кишечных паразитов. микроб. геном. 6e000402 (2020).

Google ученый

Jerlström-Hultqvist, J., Einarsson, E. & Svärd, SG Стабильная трансфекция паразита Diplomonad Спирононуклеус сальмонициды. эукариотическая клетка 111353-1361 (2012).

Статья — Товар

Google ученый

Чен, К.-С. и другие. Наборы негибридных микробных геномов, терминированные на основе данных секвенирования SMRT с длительным чтением. физ. Методы 10563-569 (2013).

КАС
Статья — Товар

Google ученый

английский, переменный ток и другие. Рассмотрим пробел: обновление генома с использованием технологии секвенирования длинного считывания Pacific Biosciences RS. ПЛЮС ОДИН 7e47768 (2012).

реклама
КАС
Статья — Товар

Google ученый

Корин, С.; и другие. Canu: длинное, масштабируемое и точное чтение, установленное с помощью адаптивного взвешивания k-mer и рекурсивного разделения. Геномная точность. 27722-736 (2017).

КАС
Статья — Товар

Google ученый

Последовательность чтения архива NCBI https://identifiers.org/ncbi/insdc.sra:SRR948594 (2015).

Ли, Х. и Дурбин, Р. Быстрое и точное выравнивание коротких считываний с помощью преобразования Берроуза-Уилера. биоинформатика 251754-1760 (2009).

КАС
Статья — Товар

Google ученый

Уокер, Б.Дж. и другие. Pilon: интегрированный инструмент для всестороннего обнаружения микробных вариантов и оптимизации сборки генома. ПЛЮС ОДИН 9e112963 (2014).

реклама
Статья — Товар

Google ученый

Ли, Х. и другие. Формат Sequence/Map Alignment (SAM) и SAMtools. биоинформатика 252078-9 (2009).

Статья — Товар

Google ученый

Отто, Т.Д., Диллон, Г.П., Дегрейв, В.С. и Берриман, М. RATT: Инструмент для быстрой передачи аннотаций. Рез нуклеиновые кислоты. 39e57 (2011).

КАС
Статья — Товар

Google ученый

Majoros, WH, Pertea, M. & Salzberg, SL TigrScan и GlimmerHMM: два искателя генов с открытым исходным кодом от инициации до эукариот. биоинформатика 202878-2879 (2004).

КАС
Статья — Товар

Google ученый

Хаят, Др. и другие. Prodigal: распознавание прокариотических генов и определение сайта инициации трансляции. БМК Биоинформатика 11119 (2010).

Статья — Товар

Google ученый

Камачо, К.; и другие. BLAST+: архитектура и приложения. БМК Биоинформатика 10421 (2008).

MathSciNet
Статья — Товар

Google ученый

Марчлер-Бауэр, А. и Брайант, С. Х. CD-Search: аннотации белкового домена в полете. Рез нуклеиновые кислоты. 32W327-31 (2004).

КАС
Статья — Товар

Google ученый

Последовательность чтения архива NCBI https://identifiers.org/ncbi/insdc.sra:SRR948595 (2015).

Карп, б и другие. Обновление версии 19.0 Pathway Tools: программное обеспечение Pathway Informatics/Genomics и System Biology. Брифинги по биоинформатике 17877-890 (2015).

Статья — Товар

Google ученый

Лагсен, К.; и другие. RNAmmer: последовательная и быстрая аннотация генов рибосомной РНК. Рез нуклеиновых кислот. 353100–3108 (2007).

реклама
КАС
Статья — Товар

Google ученый

Lowe, TM tRNAscan-SE: программа для улучшения обнаружения переноса генов РНК при генетическом секвенировании. Рез нуклеиновых кислот. 25955-964 (1997).

КАС
Статья — Товар

Google ученый

Смотреть. Спирононуклеус сальмонициды Проект секвенирования полного генома. Джинбанк https://identifiers.org/ncbi/insdc:AUWU02000000 (2021).

NCBI Сборка https://identifiers.org/ncbi/insdc.gca:GCA_000497125.2 (2021).

Последовательность чтения архива NCBI https://identifiers.org/ncbi/insdc.sra:SRP028565 (2020).

Шоу, Ф. spiro.pacbio.sorted.cram, ФигшерИ https://doi.org/10.6084/m9.figshare.20410980 (2022).

Сюй, Ф. spiro.illumina.sorted.bam, ФигшерИ https://doi.org/10.6084/m9.figshare.20288733 (2022).

Краковка С., Рибаке У., Миямото Ю., Экманн Л. и Свярд Г.С. Характеристика устойчивости к метронидазолу. Кишечный лямблиоз Линии по сравнительной транскриптомике и протеомике. Передо мной. микробиол; 13834008 (2022).

Статья — Товар

Google ученый

Гу, З., Гу, Л., Эйлс, Р., Шлеснер, М. и Брорс, Б. Circlize реализует и улучшает круговую визуализацию в R. биоинформатика 302811-2812 (2014).

КАС
Статья — Товар

Google ученый

Курц, С.; и другие. Универсальная и открытая программа для сравнения больших геномов. Геном биол. 5Р12 (2004).

Статья — Товар

Google ученый

Чакраборти, М.; и другие. Скрытая генетическая изменчивость формирует структуру функциональных элементов. Фруктовая муха. физ. Жене. 5020-25 (2018).

КАС
Статья — Товар

Google ученый

Уикхэм, Х. ggplot2: элегантная графика для анализа данных. Спрингер (2016).