Протокол систематического обзора для оценки роли вирусных культур для оценки воздушно-капельной передачи SARS-CoV-2

В недавней статье, опубликованной на medRxiv* Сервер препринтов Исследователи предоставляют протокол систематического обзора для оценки вирусных культур на предмет воздушно-капельной передачи коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома 2 (SARS-CoV-2).

Стади: Вирусные культуры для оценки воздушно-капельной передачи SARs-CoV-2: протокол систематического обзора (версия 1).. Кредит изображения: Design_Cells / Shutterstock

Распространение респираторных капель, содержащих инфекционные микроорганизмы, сохраняющие заразность при взвешивании в воздухе в течение длительного времени и на расстоянии, приводит к передаче инфекционного агента по воздуху. Учитывая широкое глобальное воздействие нынешней пандемии коронавируса 2019 (COVID-19) и высокую восприимчивость новых вариантов SARS-CoV-2, существует острая необходимость в надежных доказательствах воздушно-капельной передачи SARS-CoV-2.

Предыдущие систематические обзоры

Исследователи в текущем исследовании недавно провели систематический обзор 67 первичных исследований и 22 обзоров воздушно-капельного переноса SARS-CoV-2, чтобы выявить, оценить и обобщить доказательства этого.

Включенные исследования были низкого качества, не имели стандартизированных методов и были обсервационными. В общей сложности было предпринято 10 исследований вирусных культур, но они не позволили сделать какие-либо твердые выводы из-за отсутствия в культурах извлекаемого SARS-CoV-2. Остальные обзоры указывали на отсутствие доказательств, подтверждающих передачу SARS-CoV-2 воздушно-капельным путем. Большинство первоначальных исследований идентифицировали РНК SARS-CoV-2 в воздухе, но не смогли обнаружить инфекционный вирус SARS-CoV-2.

Затем исследователи провели систематический обзор, в котором оценивали передачу и потенциал передачи для бессимптомных пациентов с SARS-CoV-2. В этом обзоре использовались данные исследований вирусной культуры, пороговых значений цикла полимеразной цепной реакции (ПЦР) и секвенирования генов. Возможные доказательства передачи SARS-CoV-2 от бессимптомных или предсимптомных пациентов были получены в результате этих высококачественных исследований, а также дополнительной информации от авторов этих исследований.

Вскоре после публикации этого систематического обзора было опубликовано несколько новых исследований, посвященных воздушно-капельной передаче SARS-CoV-2. Кроме того, в обзоре также была разработана основа для получения надежных данных о передаче инфекционных респираторных агентов.

Рамки для будущего систематического обзора

В будущем исследователи планируют провести систематический обзор для оценки доказательств воздушно-капельной передачи SARS-CoV-2 из высококачественных исследований, подтверждающих инфекцию с использованием продольной ПЦР или вирусных культур с генетическим секвенированием или без него. Это исследование направлено на то, чтобы определить, являются ли образцы SARS-CoV-2, находящиеся в воздухе, заразными. Если да, исследователи также планируют оценить долю SARS-CoV-2, необходимую для заразности в воздухе, время и расстояние, в течение которого он остается заразным в воздухе, а также взаимосвязь между значениями ct ПЦР в воздухе и заражением образца. т. е. случаи цепной передачи, которые представляют собой фактические доказательства передачи SARS -CoV-2 передается по воздуху, условия, необходимые для того, чтобы SARS-CoV-2 оставался заразным в воздухе на большие расстояния.

В систематический обзор будут включены только исследования с серийной количественной ПЦР с обратной транскриптазой (qRT-PCR) или вирусными культурами, с генетическим секвенированием или без него, а моделирующие или прогностические исследования будут исключены.

С 10 сентября 2020 г. по 30 декабря 2021 г. для обновления результаты предыдущих обзоров.

Извлечение переменных будет основано на стандартной модели извлечения и оценки данных. Извлеченные данные будут включать тип исследования, методы выборки, условия исследования и характеристики населения.

Кроме того, два рецензента по отдельности определят пригодность исследований для включения в анализ. Если обсуждение между рецензентами не может разрешить какие-либо разногласия во мнениях, вопрос решает третий рецензент.

Исследователи планируют использовать методы из своего предыдущего обзора бессимптомных и бессимптомных пациентов с SARS-CoV-2, чтобы определить цепочку передачи SARS-CoV-2. Согласно предыдущему обзору, приемлемыми исследованиями были исследования с документально подтвержденным потенциалом досимптомной и бессимптомной передачи SARS-CoV-2, адекватным мониторингом и отчетностью о симптомах SARS-CoV-2, а также выявлением инфекции SARS-CoV-2 от вируса. культура.

Чтобы определить качество включенных исследований, исследователи намерены охарактеризовать источник популяции, методы исследования, образцы SARS-CoV-2, отчеты о результатах и ​​эпиднадзор.

Систематический обзор будет проводиться в соответствии с предпочтительными условиями отчетности для систематических обзоров и Руководством PRISMA. Если позволяют данные, также проводятся описательный анализ и анализ подгрупп.

*Важная заметка

medRxiv публикует предварительные научные отчеты, которые не прошли рецензирование и поэтому не должны считаться окончательными, определять клиническую практику/поведение, связанное со здоровьем, или рассматриваться как установленная информация.