Как извлечь ДНК из зубов 500-летнего человека

Ниже приводится выдержка из Происхождение: генетическая история Америки. Дженнифер Рафф.

Отказ от ответственности: когда вы покупаете продукты по ссылке Bookshop.org на этой странице, Science Friday может получать небольшую комиссию, которая помогает поддерживать нашу журналистику.

Прошло много времени с тех пор, как я работал на скамейке, но я тоже Начат процесс дезинфекции 500 поверхностейГенеральная-старые зубы —Замочите в отбеливателе, промойте ДНК-бесплатная вода, А 10— Минутный сеанс в небольшом ультрафиолетовом лайтбоксе на стол —Я с облегчением обнаружил, что моя «рука» все еще держит меня. противоположный-Практика лаборатории загрязнения в старой лаборатории дотошнаНу и дела, но я нашел, что это также переведено на отличный язык Подготовка к пандемии коронавируса. Вы никогда не должны касаться Ваше лицо в ваших руках. Вы никогда не должны передавать свои руки Откройте пробирки, не оставляйте пробирки или контейнеры с закрытыми крышками. Слишком длинный момент. Каждый раз, когда вы касаетесь своих рук На любой поверхности вы должны отбелить ее после этого. все время ты Заканчивая работу в лабораторном помещении, следует отбелить оба Стол и оборудование, которые я использовал. Это требует постоянного мышленияОбилие и часы обучения для работы в этой среде. Исследователи-тестировщики звонят всем, кто имеет опыт работы На скамейке кто-то «в хорошие руки». В древнем мире ДНК это в основном касается того, кто может сохранять такую ​​бдительность в предотвращении заражения.

Этот чрезмерный интерес к стерильным технологиям — всего лишь одна истина.Сын, почему так мало людей хотят работать в нашей сфере. Другая причина Как редко удается получить ДНК из костей. В то время как вы можете получить огромное количество ДНК только из мазка Для щеки живого человека древняя ДНК совсем другая история. Поврежденные, фрагментированные, редкие и смешанные в огромных количествахСовременные связи загрязнения ДНК, молекулы редко когда-либо присутствует в обнаруживаемых количествах в любой кости или зубе, И процесс его восстановления очень сложен.

Моя уверенность росла в моих руках, когда я перекладывала чистый, высушенный зуб в большой шкафчик на ближайшей скамейке. Этот колпак, сделанный из прозрачного плексигласа с откидной передней частью, которая открывалась ровно настолько, чтобы я мог просунуть внутрь руки, фактически был старой ДНК-лабораторией внутри лаборатории. У нас было несколько из них, разбросанных по комнате, каждая из которых была посвящена нескольким этапам процесса выделения ДНК. Разделение нашей деятельности на разные закрытые помещения является еще одной важной мерой по предотвращению загрязнения. Но на первом этапе процесса экстракции нужно было проявлять больше осторожности; Механическое сканирование образца кости или зуба может распространить материал по всей лаборатории. Это означает, что мне нужно будет работать в меньшем пространстве внутри капюшона: если быть точным, в маленьком пластиковом перчаточном ящике, который может улавливать любой сыпучий порошок. Я просверлил одно из отверстий сбоку и начал аккуратно работать с зубом. Поверхностный материал зубов попал в небольшой пластиковый лоток, подлежащий утилизации, скорее всего загрязненный. Я расширил отверстие, которое просверлил, и соскреб порошок с внутренней части зуба во второй лоток (предварительно очищенный под воздействием УФ-излучения). После того, как я вынул лоток из коробки, я взвесил его на весах: 0,025 грамма — примерно половина необходимого мне количества материала. Я продолжал сверлить зуб, изо всех сил стараясь не сломать его во время сверления порошка. Это был мой наименее любимый этап во всем процессе — я очень нервничал и был сосредоточен, пока не перемешал белый порошок в пластиковой пробирке без ДНК.

Я вздохнул, когда наконец извлек достаточно порошка, чтобы двигаться дальше. Мы стараемся не брать больше останков человека, чем это абсолютно необходимо для получения ДНК, и существует огромное давление, чтобы не повредить маленькие образцы.

Но награда стоит стресса.

Удивительно, если задуматься: этот небольшой экстракт 500-летней давности, этот порошок, размером меньше щепотки соли, может содержать записи тысяч лет от предков этого человека. Я наполнил пробирку раствором, содержащим химическое вещество для выделения кальция из порошка, а затем добавил небольшое количество фермента, который разжевал все белки в образце. Я добавил те же химические вещества во вторую пробирку, которая должна была служить отрицательным контролем: тест, чтобы увидеть, была ли введена какая-либо ДНК на какой-либо из более поздних стадий процесса экстракции. Если бы в конце четырехдневного процесса в моем отрицательном контроле появилась ДНК, я бы предположил, что образец тоже был заражен. Затем мне придется оценивать каждый потенциальный источник загрязнения — химикаты, трубы, оборудование, верстак, воду и мою собственную технологию — до тех пор, пока я не выявлю и не устраню проблему. Группы по исследованию древней ДНК были построены на доверии: доверии между общинами предков и главными исследователями, доверии между главными исследователями и администраторами университетов, доверии между главными исследователями и студентами, доверии к тому, что ваши коллеги-исследователи находятся в надежных руках, и доверии к тому, что реагенты являются ядерными и не содержат ДНК, и верим, что каждый немедленно сообщит о заражении и сделает все возможное, чтобы смягчить его.

Адаптированы из Происхождение: генетическая история Америки. © 2022 Jennifer Raff и перепечатано с разрешения Twelve Books / Hachette Book. Коллекция