Результаты полногеномного исследования ассоциации более чем 20 000 человек продемонстрировали обратную связь между генетически предсказуемым началом курения и болезнью Паркинсона (БП), которая согласуется с предыдущими отчетами. Прежде всего, остаются неизвестными механизмы, лежащие в основе обратной связи между курением и болезнью Паркинсона.1
Предыдущие исследования выявили связь с человеческим лейкоцитарным антигеном (HLA).HLA) области, особенно с HLA-DRB1. Опубликовано в двигательные расстройства, Главный исследователь Алексис Эльбаз, доктор медицины, доктор философии, и его коллеги провели менделевский рандомизационный (MR) анализ, используя 182 однонуклеотидных полиморфизма (SNP), связанных с началом курения, в качестве полезных переменных в слоях, определенных HLA-DRB1. Окончательная выборка включала 12424 случая и 9480 контролей из 26 исследований с не менее чем 50 случаями или контрольной группой европейского происхождения.
Эльбаз и др. пишут: «Хотя это одно из самых убедительных открытий при БП, механизмы, лежащие в основе его обратной связи с курением, остаются неизвестными. Эта работа представляет собой первый пример крупномасштабной репликации взаимодействия генов и окружающей среды при БП и позволяет предположение о биологическом механизме для объяснения связи.Обратное курение и болезнь Паркинсона в контексте более крупного исследования взаимосвязи между иммунной системой и болезнью Паркинсона».
В общей сложности 11 аминокислот (АК) (9 обратно, 2 положительно) были связаны с БП, и все они кодировались HLA-DRB1. После пошаговой процедуры обратного отбора 2 АК, валин в положении 11 (V11) и S37, оставались значимо связанными с болезнью Паркинсона (ОШ 0,85; 95% ДИ 0,79–0,92; с = 2,2 х 10-5); Несмотря на это, V11 показал более сильную связь (ОШ, 1,0; 7 95% ДИ, 1,00–1,14; с = 0,040).
Читать далее: Модуляция пепинемабом экспрессии SEMA4D требует дальнейшего развития при болезнях Хантингтона и Альцгеймера.
Ранее данные Hollenbach et al. сообщали об обратной связи PD с общим эпитопом (SE), группой АК, кодируемых HLA-DRB1, Только при наличии V11.2 В новом исследовании не было обнаружено значительного взаимодействия между SE и V11.с = 0,29), при этом только V11 остается ассоциированным с болезнью Паркинсона (ОШ 0,81; 95% ДИ 0,74–0,89; с <10-3), когда оба включены в модель.
В предыдущем метаанализе самой сильной связью была обратная связь с гистидином в положении 13 (H13) в HLA-DRB1и тесно связан с V11.3 Кроме того, в недавнем исследовании Yu et al. были выделены 3 аминокислоты — V11, H13 и H33 — кодируемые HLA-DRB1 Это обратно связано с БП.4 Точно так же Эльбаз и его коллеги обнаружили, что ассоциация H13 и H33 с БП объясняется V11.1
Между генетически ожидаемым началом курения и болезнью Паркинсона исследователи обнаружили общую связь 0,86 (95% ДИ, 0,73–1,05; с = 0,10) без признаков гетерогенности между SNP (с = 0,40). Носители хотя бы 1 остатка V11 были обнаружены у 26% контрольной группы по сравнению с 22% случаев. Примечательно, что были обнаружены обратные ассоциации между генетически предсказуемым началом курения и БП в отсутствие V11 (ОШIVW, 0,74; 95% ДИ, 0,59-0,93; с = 0,0092), но не в его присутствии (ИЛИIVW, 1,25; 95% ДИ, 0,83-1,87; с = 0,29), с положительным и значимым взаимодействием (с = 0,03).
Чтобы проверить эффект V11, закодированного с помощью HLA-DRB1 Аллели и гомоцитруллинирование (HC) пептидов, полученных из α-синуклеина, при аффинности связывания, Elbaz et al. описали аффинность связывания для четырех групп, определяемую комбинацией V11 и HC. Все различия были проверены 2 × 2 с использованием непараметрического критерия с поправкой Уилкоксона для множественных сравнений. Все, по сравнению с V11 и HC, группы V11 + HC и V11 — HC + были связаны со сниженной аффинностью, с более сильным эффектом для HC, чем для V11 +. Альтернативно, в присутствии HC+, V11+ увеличивает аффинность связывания или не оказывает никакого действия (Y39).
Среди 64 аллелей HLA Гены класса 2, 5 достоверно и обратно связаны с болезнью Паркинсона.HLA-DQA1* 03:01, HLA-DQA1*03:03; HLA-DQB1*03:2; HLA-DRB1* 04:01 и HLA-DRB1* 04:04). Примечательно, что ОШ корреляции между всеми HLA-DRB1*аллели 04 в сочетании с PD составляли 0,84 (95% ДИ, 0,78–0,91; с = 3,9 х 10-6).
More Stories
Ученые раскрыли секреты потери морских звезд и возобновления роста конечностей
Комплексное мероприятие сообщества людей с деменцией в Ратуте, посвященное Всемирному месяцу борьбы с болезнью Альцгеймера.
Новое исследование массивного надвига предполагает, что следующее большое землетрясение может быть неизбежным