Генетическое наблюдение обнаруживает, помогает остановить вспышки в больницах

Основные розетки:

• Полногеномное секвенирование в режиме реального времени выявило генетически родственные популяции и определило потенциальные источники.
• Тогда вмешательства смогли предотвратить дальнейшую передачу.

СИЭТЛ — Больница использовала секвенирование всего генома в режиме реального времени для обнаружения генетически связанных кластеров инфекций, выявления потенциальных источников и прекращения дальнейшей передачи, сообщают исследователи.

«Ранее мы исследовали влияние нашего инструмента под названием «Расширенная система обнаружения передачи, связанной с оказанием медицинской помощи» (EDS-HAT), которая сочетает в себе мониторинг полногеномного секвенирования (WGS) и машинное обучение электронных медицинских карт для обнаружения и расследования вспышек бактериальных патогенов. » Александр Дж. Сандерман, MD, MPHИ Об этом сообщил эпидемиолог и доцент кафедры инфекционных заболеваний Питтсбургского университета.

По словам Сондермана, EDS-HAT смогла обнаружить крупные вспышки, которые в противном случае остались бы незамеченными, что в конечном итоге может предотвратить серьезные инфекции и сократить расходы.

«Учитывая эти результаты, мы сосредоточились на проведении WGS в режиме реального времени в нашей больнице в ноябре 2021 года для выявления и расследования вспышек», — сказал он. «Цель этого исследования заключалась в том, чтобы поделиться значимыми вспышками, которые мы обнаружили через год после проведения эпиднадзора за WGS, а также эффектами профилактики инфекций после проведения вмешательств».

Сондерман и его коллеги проводили еженедельное наблюдение в период с 1 ноября 2021 г. по 31 октября 2022 г., собирая и секвенируя культивированные изоляты бактериальных патогенов от пациентов, госпитализированных на 3 или более дней, или тех, кто недавно подвергался медицинскому обслуживанию. в предыдущие 30 дней.

Согласно выводам, представленным Сандерманом на весенней конференции Общества эпидемиологии здравоохранения, изоляты, которые имели 15 или менее однонуклеотидных полиморфизмов (SNP), считались генетически родственными группами, за исключением клостридоиды трудный Считается, что изоляты связаны с 2 или менее SNP. Изоляты, считавшиеся родственными группами, были исследованы на предмет эпидемиологических связей, и были предприняты меры по прекращению передачи.

В течение года исследователи секвенировали 1633 инфицированных пациента и выявили 74 группы по 210 (12,9%) пациентов, в среднем по два пациента в группе. Согласно исследованию, изоляция 118 (56,2%) пациентов имела эпидемиологическую связь с предыдущей изоляцией, что, по словам исследователей, указывало на возможную передачу инфекции, а 66 из 74 групп (89,2%) подверглись профилактическим мероприятиям после уведомления.

В общей сложности 69 вмешательств, включая образовательный блок (n = 28), мониторинг гигиены рук (n = 16), усиленную уборку (n = 16), экологические культуры или удаление эндоскопа (n = 7) и улучшенный микробиологический мониторинг (n) = 2), а затем оно было выполнено.

После этих вмешательств было выявлено 59 последующих инфекций, в том числе 17 (28,8%) без четкой эпидемиологической связи и 41 (69,5%) с ассоциацией либо с новым путем передачи (n = 37), либо с тем же путем до вмешательства (n = 4). Во время исследования была только одна инфекция в группе, возникшая после вмешательства одним и тем же путем, что, как подозревали исследователи, было передачей устойчивости к ванкомицину на основе одиночества. Энтерококк фекальный.

По словам Зундерманна, в целом эти результаты показали, что они смогли быстро обнаружить бактериальные вспышки как минимум у двух пациентов с помощью мониторинга WGS, а затем смогли направить мероприятия по профилактике инфекций там, где были обнаружены эпидемиологические сходства.

«Суть в том, что мы показываем, что EDS-HAT при работе в режиме реального времени может эффективно выявлять важные вспышки заболеваний, которые иначе нельзя было бы пропустить, и направлять меры по профилактике инфекций для предотвращения будущих инфекций», — сказал Сондерман.

Добавить тему для оповещений по электронной почте

Получать электронные письма, когда новые статьи публикуются на

Пожалуйста, укажите свой адрес электронной почты, чтобы получать электронные письма, когда новые статьи публикуются на .

data-action = Подписаться > Подписаться

Нам не удалось обработать ваш запрос. Пожалуйста, повторите попытку позже. Если эта проблема не устранена, свяжитесь с нами по адресу [email protected].

Вернуться к Хелио

Весенняя конференция SHEA