Реконструкция генов европейских шерстистых носорогов по ДНК в помете хищников: ScienceAlert

Возможно, мы игнорируем удивительно богатый источник древней ДНК.

Ученым удалось реконструировать митохондриальный геном вымершего шерстистого носорога (Античная Целодонта) – из ДНК, выделенной из окаменелых фекалий пещерных гиен (Крокута Крокотта Спилья), на котором я ужинал.

Это первый геном шерстистого носорога, обнаруженный в Европе; Все предыдущие геномные данные по этому виду были получены от сибирских животных. Возможно, это могло бы дать нам некоторые подсказки о региональных различиях между стадами носорогов, но это также предполагает, что окаменелые фекалии, или Копролитыможет быть ценным ресурсом.

«Созданные здесь сборки митогенома являются первыми записями митогенома европейского шерстистого носорога и, следовательно, являются важным ресурсом, помогающим определить физическую географию этой знаковой мегафауны плейстоцена». Исследователи пишут в своей статье.

«Тот факт, что он был относительно легко извлечен из копролита другого вида (т.е. не потребовалось никаких останков, непосредственно связанных с шерстистым носорогом), подчеркивает ценность получения геномных данных из широкого спектра материалов».

Фактически копролит превратился в историческую золотую жилу. Из сохранившихся фекалий мы можем узнать, чем питались люди и животные в прошлые эпохи, изучить, какими паразитами они были заражены, и даже изучить изменения в микробиоме кишечника человека.

Команда под руководством молекулярного биолога Питера Андреаса Зибера из Университета Констанца в Германии изучала окаменелый помет гиены из… Средний палеолит На территории нынешней Германии период длился примерно 300 000–30 000 лет назад.

Этот копролит был раскопан и находился в нем. Коллекции музеянравиться Многие копролиты делают сейчас. Статья, опубликованная в прошлом году Подтверди это Копролиты в музейных коллекциях — заброшенный и неиспользованный ресурс в изучении биологической истории нашей планеты.

Зибер и его коллеги использовали специальный инструмент для извлечения материала из копролита, подготовили ДНК для считывания и пропустили результаты через секвенатор ДНК.

ДНК деградировала. Но исследователям удалось восстановить генетический материал как пещерной гиены, так и шерстистого носорога, и сравнить его с другими геномами, как современными, так и древними.

Хотя ДНК носорога была получена только из одного образца, она смогла рассказать исследователям что-то новое об этом виде и его разнообразии на территории Евразии.

На самом деле, между европейскими носорогами, которые в конечном итоге стали пищей гиен, и сибирскими носорогами была достаточная разница, чтобы предположить, что эти две группы начали диверсифицироваться некоторое время назад. Европейский носорог начал делиться где-то между 2,5 миллионами и 150 000 лет назад.

Это прямо противоречит гипотезе о том, что в позднем плейстоцене носороги неоднократно расширяли ареал в Западную Европу, по крайней мере, во время коллапса, к которому принадлежит этот носорог.

Дальнейшее восстановление и анализ ДНК величественных древних носорогов помогут узнать больше об их истории, даже если нам придется восстанавливать ее из чего-то явно менее величественного, чем фекалии.

«Как и в случае с этими образцами». Исследователи пишут«Многие артефакты, обнаруженные в ходе предыдущих раскопок и хранящиеся в коллекциях, до сих пор являются в значительной степени забытым источником древней ДНК».

Исследование было опубликовано в Письма по биологии.